治疗小儿纵隔囊肿及肿瘤没有有效的药物，手术治疗才是有效的治疗方法，但是对于恶性肿瘤可以给予药物化疗。

小儿纵隔囊肿及肿瘤可以对纵隔内的器官造成压迫，通过口服药物并不能有效的使肿瘤减小，有些肿瘤是恶性肿瘤，生长速度比较快，药物也不能明显延缓肿瘤的生长速度。

缓解患者纵隔受压的有效手段就是手术，手术后可以快速的缓解患者的症状。对于恶性肿瘤的患者术后可以给予药物化疗，化疗的目的是减轻肿瘤复发的风险。