小便时肚子疼和泌尿系统以及妇科疾病相关。小便时肚子疼多数是发生在女性身上的，小便时肚子疼不是在生理期，就会是泌尿道感染，尤其是膀胱炎和尿道炎。

由于女性的尿道比较短，特别容易发生尿路感染，会出现尿频、尿急以及尿痛的症状，同时伴有下腹部不适的症状。妇科疾病也会出现上述情况，常见于子宫内膜炎和盆腔炎。

小便时肚子疼痛，如果是在月经期间，则是月经所导致的，属于正常的生理现象。平日饮食上要多注意避免食用辛辣、刺激的食物，饮食以清淡为主。