根据前列腺囊肿所处部位和引起的症状不同，前列腺囊肿所需要进行的手术难易程度也不相同。

对于囊肿凸向尿道中的患者，可以直接行经尿道前列腺囊肿电切术，手术操作相对比较简单，且术后的恢复一般相对较好。如果前列腺囊肿位于前列腺内部，年轻患者可以选择在彩超定位下进行直肠或会阴部行前列腺囊肿穿刺，手术也相对简单。

中老年男性伴有排尿困难者可以行经尿道前列腺电切术，将前列腺增生的腺体切除，同时将囊肿切掉，这种手术的风险及操作难度相对会增大。