有甲减怀孕5个月胎儿偏小，如果偏小一周左右，且孕妇甲减得到有效控制，这种偏小是属于正常的。因为胎儿偏小还有可能和孕妇的月经周期延长以及受精卵着床较晚有关。

孕妇有甲减有可能会导致胎儿偏小，甚至甲减严重者如果不及时补充，有可能会导致胎儿智力受损，形成呆小症。因为胎儿的营养是来自于母体的，如果母体中缺乏甲状腺素，就会影响胎儿的神经系统和骨骼系统的发育，有可能会导致胎儿呆小病等。

所以，有甲减的患者怀孕以后，一定要在医生的指导下，服用治疗甲减的药物如左甲状腺素钠片，并且定期复查甲功，来调整用药剂量。经调整后的甲状腺功能恢复正常，而胎儿偏小还可能与孕妇的营养状况以及遗传因素等有关。