疱疹性咽峡炎没有特效的治疗药物，主要是对症治疗和支持治疗。发热，可以首先行物理降温，咽痛、拒食的宝宝，可以先流食喂养。

如果患儿长时间不能进食、精神不佳，需要静脉输注营养，以保证孩子的健康和恢复，疱疹性咽峡炎的病程一般是4～6天，有自限性，预后良好。

家里如果有人患疱疹性咽峡炎，需要隔离患者，将患者所用的东西进行消毒清理，以免感染他人，造成他人感染发炎。