偏头痛持续两天，需要进行脑部的核磁共振的检查、脑电图的检查。因为偏头痛有可能还存在脑供血不足、脑出血、蛛网膜下腔出血等神经系统的疾病，所以会让患者的偏头痛持续地存在。

进行脑部的核磁共振检查，可以排除脑出血、脑血栓、蛛网膜下腔出血等疾病。

进行脑电图的检查要排除癫痫病的可能性，因为癫痫病发作的时候，也有可能让患者出现头痛的感觉。当然在需要的情况下，还要考虑进行神经科医生其他的相关检查。有的也需要耳鼻喉科的检查，要注意鼻窦炎造成的偏侧头痛。