上完小便后尿道会疼，最常见原因如下：

1.尿道炎。属于尿路感染的一部分，是由于不洁的性接触，或者其他原因而导致的尿道炎症表现。典型的症状就会出现为排尿后疼痛或者排尿时疼痛，不排尿时疼痛减轻，同时可能会伴有尿频、尿急。严重的患者可能会出现体温升高或者尿道分泌物增多，比如出现白色或者黄色的分泌物等，需要进行尿液化验检查进一步地明确诊断。

2.男性前列腺炎可以出现小便后尿道疼痛，同时可能会伴有排尿时尿道口滴白的现象，同时会伴有会阴区胀痛或者尿频、尿急。严重的患者可能伴有性功能异常，需要进行尿常规化验、前列腺液化验等进一步明确。

3.尿道损伤。比如骑跨伤或者暴力打击导致尿道挫伤，可以出现小便后疼痛。严重的患者可能会出现血尿的症状，一般都有明确的受伤经过或者受伤史。