军团病肺炎的病死率约为15%，年龄越大，病死率越高，有基础疾病或免疫缺陷者病死率更高，死亡原因多数为呼吸衰竭，其次为休克和急性肾功能衰竭，如能早期诊断，积极有效治疗，病死率可以降低。

对于军团病可以通过以下方法进行预防：

饮水消毒，加氯或煮沸可杀灭病菌，对空调系统应予关闭，进行消毒清洗，对于供水系统使用器材，喷雾器等进行卫生管理。可通过预防措施处理军团病造成的公共卫生危险，虽然不可能根除传染源，但可以显著减少风险。

军团病的预防依赖于对可能感染源的良好管理，包括定期清洗和消毒以及采用其他物理和化学措施，尽量减少生长，如对冷却塔定期进行清洗和消毒，并经常或不断添加生物杀灭剂，在温泉池中保持足够水平的氯等生物杀灭剂，并至少每周完全排水一次，清洁整个系统。在医院、工业场所、旅馆、休闲中心等采用这些措施，可极大的减少军团菌污染的可能性，并预防散发病例的发生。