胆汁性肝硬化可以使用熊去氧胆酸这种药物来治疗。因为这种药物可以减少胆酸的分泌，也可以减少胆酸对肝细胞的毒性作用，从而起到保护胆管细胞以及肝细胞。

除此以外，也可以给患者使用非诺贝特、布地奈德、奥贝胆酸、利福平等药物缓解症状。尤其是患者瘙痒症状较为严重时，利福平可以作为二线用药治疗，但是考虑到有潜在的肝毒性。因此，在使用药物治疗过程中，需要密切监测肝脏的血清学指标。

部分患者也可以使用免疫抑制剂，比如氨甲蝶呤、硫唑嘌呤等。