怀孕45天B超宫內看不到孕囊是不正常的，有可能是生化妊娠或者宫外孕。对于平素月经规律的女性而言，出现停经史要确定是否怀孕，通过监测血或者尿的HCG就可以定性判断是否怀孕。如果血或者是尿的HCG呈阳性，最终确定是宫内怀孕，胚胎发育是否与停经天数相符，还要进行妇产科的超声检查。一般情况下，在停经35天左右经阴道超声就可以监测到孕囊，在停经42天左右可以看到胎芽，而在停经45天左右则能看到胎心波动，此时才是真正意义上的宫内活胎。