肝结节的病因复杂，要明确病因才能选择好的治疗方法。肝结节有良性结节和恶性结节，像肝脏钙化结节、结节性增生、血吸虫肝硬化结节以及肝炎肝硬化结节均是良性结节。没有恶变的情况下不需要治疗，只需要治疗原发性的病变。

而有些肝硬化结节不排除癌变的情况，可以进行活检，特别是病毒性肝炎引起的肝硬化结节，在影像学检查下提示有强化，则需注意有癌变的可能。要结合甲胎蛋白以及其他检查，必要时行肝穿刺活检或手术治疗。

有些肝硬化造成的脾亢，需要手术治疗。这种肝硬化结节即使手术当中没有癌变，也需要取活检，明确肝脏结节的性质。