小便时肛门坠胀的原因很多，具体如下：

1.女性妇科炎症或者男性前列腺增生肥大迁延泌尿道引起的，会伴有分泌物增多、小便次数多、排尿急迫、排尿疼痛、尿不尽感等症状。可以在医生指导下服用药物进行治疗。

2.痔疮、肛周脓肿、肿瘤等压迫泌尿道引起。会伴有排便出血、排便疼痛、肛周潮湿、肛周瘙痒等症状。可在医生指导下服用药物，外用中药液或者高锰酸钾溶液熏洗坐浴，促进肛周血液循环、松解肛周肌肉、缓解坠胀等不舒服症状。

3.直肠黏膜松弛。特别是直肠黏膜内脱垂时，脱垂的黏膜会压迫泌尿道及肛门，出现排大小便时肛门下坠、憋胀等症状，可通过手术切除多余黏膜，改善症状。