首先引起大便肛门疼痛的原因有很多种，但是不同原因引起的疾病，其严重性也是不一样的，而且治疗方法也是不一样的。比如常见的疾病有肛周脓肿、肛瘘急性发作、肛窦炎、直肠炎、梅毒、阴部疱疹、肛裂、血栓性外痔、嵌顿性痔、直肠肛管部的恶性肿瘤等疾病。比如肛窦炎、直肠炎、肛裂引起的疼痛疾病就相对较轻。如果是直肠肛管部的恶性肿瘤、肛周脓肿引起的疼痛，那就比较严重。针对不同的疾病治疗方案是不一样的，比如肛周脓肿、肛瘘急性发作、直肠肛管部的恶性肿瘤主要是以手术治疗为主。比如肛裂、血栓性外痔早期可以采用保守治疗。