真菌性食管炎的确诊首先就是要有食管炎的症状，如进食以后有阻挡感并且吃食物以后会有呕吐的现象的产生，以及胸骨后的疼痛。因为真菌性食管炎是一个发展病程较长的疾病，所以它的病程还是比较长的，而更确诊的方法还是进行食管镜的检查，并且取出里面的炎性组织来进行显微镜下检查，也就是进行食管炎部位的涂片检查，在里面可以发现真菌，这是确诊最有利的证据。

要提高患者的抵抗力，合理地使用抗生素，注意饮食卫生。