儿童牙齿有黑色污垢的原因主要有以下两个方面：

1.儿童食用了含有色素的食物或者饮料，造成食物残渣或色素吸附在牙齿表面而呈黑色污垢，通过有效刷牙就能清洁干净。

2.在临床上比较常见，黑色污垢是龋齿造成。儿童如果没有养成良好的刷牙习惯，尤其爱吃甜食，就很容易发生龋齿。而龋齿是进行性疾病，不就医治疗是无法阻断其发展，可以造成牙体硬组织的色、形、质改变，在颜色上就可以表现为有黑色污垢，形态上可以有龋洞发生，需要及时去医院补牙治疗。