卵巢巧克力囊肿是拍具有生长功能的子宫内膜异位在卵巢皮质内生长，发生周期性的出血，而囊内陈旧性的血液积聚，形成咖啡色粘稠液体，象巧克力样。

卵巢巧克力囊肿常见的症状有痛经，痛经多见于月经开始前1-2日出现，以月经第1日最为剧烈，以后逐渐减轻并持续整个月经期。由于巧克力囊肿可导致卵巢输卵管周围广泛粘连，使输卵管梗阻或引起扭曲，造成输卵管蠕动异常影响拾卵和受精卵的运输功能而导致不孕。而且还可以影响卵泡发育，造成排卵障碍引起不孕。另外，由于巧克力囊肿经常会在经期出血压力增加而出现破裂，可造成下腹部或盆腔深部疼痛。巧克力囊肿，还可以引起月经异常和性交痛等。