肛门两侧发红、疼痛，要保持局部的清洁、干燥，前往肛肠外科确诊病因，根据其病因进行对症治疗。

1.如果是肛裂引起的肛门两侧发红、疼痛，可以用高锰酸钾按照1：5000的比例坐浴15分钟，局部涂抹去腐生肌的药膏，如痔疮膏、生肌膏等。

2.如果是细菌感染引起的肛门两侧发红、疼痛，可以涂抹抗感染的药膏，如莫匹罗星软膏、红霉素软膏，消除炎症，改善疼痛。

3.如果是痔疮引起的肛门发红、疼痛，可以应用清热解毒的中药熏洗坐浴，肛门内塞痔疮栓，外涂痔疮膏，口服地奥司明片等药物治疗。