引起男性小便后腰痛的常见疾病诱因，是泌尿道感染；也有可能患有前列腺疾病，较为常见的是前列腺慢性炎症、前列腺增生等相关疾病；患有泌尿道结石伴随感染，也可发生小便疼痛、腰痛等不适感觉。

从中医角度考虑，男性频繁进行性生活、体质差等导致肾虚，也会引起小便后腰部疼痛等不适。

为了明确疾病的诱因，可先就诊西医泌尿门诊，辅助尿液常规、泌尿系彩超等相关的检查，根据检查的提示针对性治疗。西医检查无异常提示，可就诊中医，把脉辨证后明确肾虚等类型，再针对性地给予补肾、固肾类中药汤剂调理。