宝宝拇指内扣的原因，大致包括以下两个方面：

1.正常的生理性反应。常见于1个月之内的新生儿，由于宝宝在母体内就是呈现握拳、拇指内扣状态，当宝宝出生以后短时间内还维持原有动作。这属于正常的现象，一般宝宝1个月以后会逐渐缓解。如果2个月以上的宝宝呈现持续性的拇指内扣，建议立即就诊。

2.考虑是病理性因素导致的。其中包括大脑神经中枢受到损伤，导致宝宝运动功能障碍，出现拇指内扣症状。还有可能是因为宝宝大脑发育迟缓导致的。因此，建议家长立即带宝宝去医院就诊，明确诊断后遵医嘱给予对症治疗。