男女双方都有多囊肾是可以结婚的，只是多囊肾是家族性常染色体遗传性疾病，有显性遗传和隐形遗传。显性遗传会代代相传，父母一方有多囊肾子女发病率为50%，常于成年时期发病，随着病情的加重会影响肾脏功能。

隐形遗传父母一方有多囊肾的，子女有四分之一的几率会有遗传，并且多是幼儿时期发病，随着病情的进展生活质量会有较大影响，并且随着年龄增大，患者病情也会加重从而影响肾功能。

父母双方如果都有多囊肾，子女遗传的几率至少是75%。所以双方都是多囊肾时虽然可以结婚，但是是否要小孩要慎重考虑。