当出现头晕、乏力、肚子不舒服的时候，可以采取以下的方式进行治疗：

首先，如果是急性胃肠炎所引起的可进行抗感染治疗，常选择喹诺酮类的药物，这样对肾功能和骨骼的生长有一定影响。未成年人应选择头孢类药物，腹泻明显的可口服蒙脱石散，有明显脱水倾向的应积极地给予补液。

其次，头晕、乏力、肚子不舒服也有可能是神经官能症所引起，发病后应给予药物调整神经病。有精神症状的可使用抗精神病药物或抗抑郁药物，严重失眠的应给予镇静催眠药物对症治疗控制病情。