咳嗽后头很痛，发生脑血栓的可能性不大，主要考虑是以下几方面疾病所导致：

第一，脑出血，如果患者既往有高血压的病史，当并发呼吸道感染，患者咳嗽会导致血压急剧的升高，当升高的血压超过脑血管的承受能力，会使脑血管破裂而引起头痛的症状；患者可能还会伴有言语功能障碍、饮水呛咳、吞咽困难、肢体功能障碍等症状。

第二，偏头痛发作，考虑是呼吸道感染诱发了偏头痛，发作会出现一侧或双侧额颞部搏动性的头痛、阵发性的加剧，对声音和光线敏感，会诱发偏头痛发作。