黄杆菌肺炎会引发其他并发症，主要发生在不及时治疗以及患者基础状况比较差的情况下。

由于感染加重，损害肺部的组织，导致肺功能的异常通气换气功能出现障碍，身体极度缺氧，出现呼吸衰竭，细菌产生的大量毒素进入血液，发生脓毒血症，细菌侵袭进入脑膜，导致细菌性脑膜炎的发生，出现头痛、呕吐等表现。

另外发展到后期，心、肺、肝、肾等多个器官的功能出现障碍，叫做多器官功能障碍综合征，这个时候病情就十分危重了。