咳嗽时肚子两边疼，主要考虑是咳嗽过于剧烈所致，此时会导致腹部肌肉劳累、收缩，进而引起牵拉性疼痛。因为咳嗽动作也需要腹部肌肉进行参与，所以咳嗽期间腹部肌肉也会随之剧烈震动，此时肌肉会产生乳酸，一旦出现大量的乳酸堆积，便容易引发疼痛症状。

通常针对咳嗽采取对因治疗，以及止咳、化痰药物治疗后，肚子两边疼痛的现象也会好转。

除此之外，也可以应用局部热敷的方式缓解疼痛，还要检查是否与消化不良等因素有关，当机体处于腹胀的状态中也会在咳嗽时引起疼痛症状。