婴儿先天肠道畸形的处理方法，要根据此疾病的严重程度来具体分析。如果症状比较轻微，家长可以在日常饮食中积极地调理，建议以清淡、易于消化的食物为主，这样可以减少肠道的负担。

另外，在日常生活中也要进行适当体育锻炼，可以促进胃肠道蠕动，也可以减少代谢废物在体内的存留时间，对于小儿的健康有一定的好处。

但如果婴儿先天肠道畸形症状较严重，引起了腹泻、腹胀、呕吐等表现，此时建议在医生的指导下，经过腹腔镜手术治疗。在手术之后也要定期的进行复查，避免发生严重后果。