3个月吃2次紧急避孕药，会对女性的身体造成比较大的危害。

1.由于紧急避孕药当中含有比较多的雌孕激素成分，在短期内过多服用可能会干扰女性正常的内分泌平衡，进而会造成月经周期紊乱，有时甚至会导致女性出现月经不调、闭经等。停止用药3~6个月以后，这种现象会慢慢缓解。但是也有部分女性需要按医嘱服用药物进行调理，才能使月经重新恢复正常。

2.紧急避孕药作为一种补救的措施，不能作为常规避孕措施。所以，3个月吃2次紧急避孕药有可能会导致避孕失败，也会使女性出现意外怀孕，要承受流产给身体带来的损害。