如果只是单侧肾萎缩，一般不会出现临床症状，只是在进行影像学检查时才能够发现。

如果是肾脏疾病所引起的慢性肾萎缩，比如慢性肾脏病、外伤等，可能会引起一些泌尿系统方面的症状，比如尿频、尿急、少尿、血尿、蛋白尿等。有部分患者还会出现一些全身系统症状，比如水肿、腰背部疼痛。

如果肾萎缩为肾动脉狭窄或者肾动脉梗阻所引起，可能会使血浆肾素水平升高，从而引起高血压。当双侧肾脏出现萎缩以后，肾功能可能会逐渐的丧失，在晚期甚至会出现肾衰竭或者是尿毒症。