扁平疣选择液氮冷冻之后有可能会复发，因为没有选择使用防止复发的药物。

扁平疣这种疾病是病毒感染导致，选择使用液氮冷冻之后，仅仅只是去除了表面的疣体，但是皮肤表面有可能会残留病毒。这种病毒经过时间的推移，会导致扁平疣再一次复发。

所以，想要减少因冷冻之后而导致的复发，建议在液氮冷冻之后，在皮肤表面涂抹防止复发的药物，比如重组人干扰素凝胶或者是其他类别的抗病毒药物，都能起到一定的作用。同时注意提高自身的免疫力，免疫力提高之后，病毒的抗性增加，这种疾病复发的概率也就降低了。