扁平疣出现复发，可以选择使用一些物理手段再次去除扁平疣，在扁平疣去除干净之后，还需要选择使用防止复发的药物。

扁平疣本身属于人类乳头瘤病毒感染之后导致的一种皮肤改变，复发概率较高。建议选择使用激光或者是液氮冷冻的方式去除疣体，然后口服提高免疫力的药物，比如匹多莫德颗粒或者是胸腺肽肠溶片，能够增加人体对于病毒的耐受能力，从而减少复发的概率。

同时可以在皮损表面涂抹重组人干扰素凝胶或者是抗HPV蛋白敷料，能够抑制病毒的代谢和繁殖，使残留的病毒逐渐死亡，从而达到减少复发的目的。