骶管囊肿通常不会自行愈合。目前骶管囊肿的治疗主要有临床观察，外科手术治疗以及药物治疗等等。

第一，临床观察。大部分的骶管囊肿是没有症状的，对于没有症状的骶管囊肿是不需要处理的，这部分患者可以临床观察，但是不会自行的愈合。

第二，药物治疗对于一部分症状比较轻微的患者，也不影响正常的生活，可以使用一些神经营养的药物以及止痛的药物。但是药物治疗只能够缓解症状，不能达到治愈的目的。

目前，骶管囊肿如果产生了明显的症状，首选的治疗依然是外科手术治疗，手术是在显微镜下进行的精细操作。