肥厚性心肌病的病因，目前没有完全明确。主要考虑与基因以及免疫的变化有关系。所以肥厚型心肌病发生之后，只能用药物延缓其发展。不能够用药物将取完全治愈。当肥厚性心肌病发作时，首先要控场患者的心衰症状。可以应用acei或arb类的药物来防止心室重构。

acei类的药物，包括依那普利或贝纳普利。arb类的药物，包括替米沙坦、缬沙坦等。心率快的患者还可以应用β受体阻滞剂来抗心衰治疗，如酒石酸美托洛尔、琥珀酸美托洛尔等。肥厚型心肌病的病人，还可以出现严重的心律失常。如出现实性心律失常，可以应用美西律来治疗。如果出现房性心律失常，可以应用美托洛尔或酒石酸美托洛尔、琥珀酸美托洛尔来治疗。对于肥厚型心肌病的患者来说用药物延缓其病情发展是最关键的。其次，还要预防肺内感染等感染的发生。发生肺内感染之后，有可能会诱发心衰，二者会出现恶性的循环。