一部分食管癌病人在接受了手术治疗之后，有可能出现一些后遗症，这些后遗症主要包括肺部并发症，主要以肺炎、肺不张和肺功能不全比较常见。

其次，食管癌手术之后的并发症还常见于吻合口瘘、脓胸、乳糜胸、吻合口狭窄等情况，而食管癌手术之后所导致的胃扭转、膈疝、喉返神经损伤等情况相对比较少见。

近年来，食管癌手术的死亡率随着手术技术的提高而有所下降，但是吻合口瘘仍然是术后死亡的主要原因之一。