当脚底长有水疱，并且很痒，可以通过以下方式进行处理：

1.首先建议及时到医院进行检查，因为脚底长有水疱，并且伴有瘙痒感，可能是由于真菌感染所引起的水疱型足癣，所以如果真菌检查结果为阳性，需要在医生的指导下进行抗真菌的治疗。

2.如果做真菌检查结果为阴性，可以考虑水疱是由于湿疹所引起的。可以在局部使用一些含有糖皮质激素的药物，例如丁酸氢化可的松等。

3.平时要保持脚部的清洁、干燥，避免脚部潮湿、多汗。