脚底长水泡的原因有很多，首先要明确长水泡的原因，是什么疾病导致的，才能够对症治疗。

主要考虑的疾病是真菌感染或者湿疹，需要到医院做一个真菌免疫荧光检查确诊一下。如果是真菌感染引起的，需要抗真菌治疗，可以外用阿莫罗芬搽剂或者盐酸特比萘芬凝胶，需要外用1~2个月使用才能有好的效果。

如果没有真菌感染，主要考虑是湿疹，这个时候需要局部外涂糠酸莫米松乳膏或者复方丙酸氯倍他索乳膏，同时口服左西替利嗪片或者枸地氯雷他定片进行治疗。同时鞋子穿宽松一些，穿透气的鞋袜，保持局部干燥清洁。