尿道粘膜脱垂的诊断主要是依靠临床症状、查体及相关的辅助学检查。当患者出现尿道外口的可复性肿物，并且随着时间的变化逐渐增大时，就应该考虑存在尿道黏膜脱垂的情况。

查体时可以发现在尿道外口有肿物脱出，肿物的质地比较柔软，按压比较容易出血，并且肿物可以经手法复位。

相关的检查主要包括泌尿系彩超、血常规、尿常规、膀胱镜检查等。泌尿系彩超排除有没有其它的泌尿系统肿瘤，尿常规检查可发现尿常规内有白细胞和红细胞出现，膀胱镜检查排除其它尿道内的疾病。