目前对于引发原发性舌咽神经痛的病因仍不清楚，通常认为可能与神经脱鞘有关。而继发性舌咽神经痛可能是恶性肿瘤引起的，也可能是局部或全身性炎症、血管病变等引发的。

舌咽神经痛对患者的损害是很大的，不但会引发疼痛，而且还可能会导致患者体内某些激素的释放增加，容易致使患者出现血压升高、心律失常等情况。因此一旦患病后，应及早进行治疗。

舌咽神经痛的治疗方法有很多，常用的有药物治疗、手术治疗以及针刺疗法等。医生通常会根据患者的具体情况，来选择不同的治疗方法。