肝功能三项不能查出乙肝。

肝功能三项是指谷丙转氨酶、谷草转氨酶，以及总胆红素指标，这些指标只能够评估肝脏细胞的炎症状态，以及是否有肝脏损伤。总胆红素用来评估肝脏胆道系统的胆红素转运状态。

乙肝主要是要通过乙肝五项明确诊断，如果乙肝表面抗原阳性，就可以诊断为乙肝。因此，肝功能三项不能够查出乙肝，主要还是要靠乙肝五项和乙肝病毒DNA检测明确是否乙肝。如果查出是乙肝后，则需要进一步检查肝功能三项评估肝脏炎症状态。