咽拭子检查可以分辨细菌和支原体感染，在分辨细菌感染的同时，还可以进行细菌的药敏实验，从而确定对细菌敏感的抗菌药物。而对于支原体的检测除可以通过咽拭子检查以外，通常是通过支原体抗体检测来完成，需要抽血化验的方式。

咽拭子除了可以分辨细菌和支原体以外，还可以分辨真菌、衣原体等病原体的感染。

咽拭子检查采样方便且准确率高，广泛应用于临床工作中，可以分辨出致病菌，有助于对急性咽喉炎、化脓性扁桃体炎等疾病的诊断。