早上刷牙有黄痰，可能与细菌感染引起呼吸道疾病有关，比如上呼吸道感染、扁桃体炎、鼻炎、支气管炎等，都有可能导致早上刷牙时出现黄痰。

另外，这种情况也可能与咽炎有关。特别是经常处于空气干燥的环境，经常受到粉尘刺激或者烟酒过度，容易在早上刷牙时有黄痰。同时，还有可能伴随咽部干燥、咽痛等症状。

因为，咽部属于进食与呼吸的必经通道，容易受到外界细菌侵入而引起炎症反应。一旦出现这种情况，最好及时到医院完善胸片、C-反应蛋白、血常规、痰培养、肺部CT等检查。