早晨咳嗽多与呼吸道感染有关，包括上呼吸道感染和下呼吸道感染。

上呼吸道感染主要是由于患者睡了一夜后，可能是由于张口呼吸，使喉咙处于干燥状态，所以早晨起床会引起刺激性干咳。如果是下呼吸道感染引起的，一般是因为夜间会有大量分泌物聚集在肺部或支气管，不易咳出。晨起后在纤毛摆动的情况下，会刺激分泌物排出，使患者出现咳嗽、咳痰等症状。

可以用一些抗病毒或消炎药物对症治疗，如蓝芩口服液。如有细菌感染，也可服用头孢氨苄或头孢拉定。此外，一些祛痰止咳药也可以口服，如肺力咳合剂和盐酸氨溴索。