睡觉憋醒呛咳，与呼吸系统疾病、反流性食管炎有关。

睡觉的时候被憋醒是病理性因素引起的，比如肺部疾病、左心功能不全、阵发性呼吸暂停综合征，会对患者的呼吸造成影响。比如呼吸暂停综合征的患者，睡觉时打鼾，夜间容易被频繁憋醒。除了被憋醒以外，还有呛咳的表现，与上气道咳嗽综合征、反流性食管炎等疾病有关，会导致睡觉时呛咳。

比如胃酸分泌增多，睡觉时加重了食物反流，内容物反流进食管，导致患者出现呛咳的表现。需要到大型的医院进行相关的检查，明确原因。