良性的卵巢囊肿是可以治疗的，因为卵巢的囊肿是否是良性还是恶性，都是需要通过病理取材才可以确诊的，所以对于卵巢的囊肿超过5厘米都建议行手术治疗的。因卵巢的病理组织学复杂，早期的手术可以减少对卵巢组织的破坏，还可以排除卵巢的恶性肿瘤。

同时因目前微创手术的发展，卵巢囊肿手术不需要跟以为在腹部取切口，手术后恢复很快。所以现在选择手术治疗。但因卵巢的特殊性，卵巢有生理性卵泡囊肿及黄体囊肿，生理性囊肿不会超过5厘米可以自然消退。另外输卵管卵巢囊肿是因炎症导致的，经抗炎治疗后会缩小，所以这两种情况可以暂缓手术的。