手术是能够根治肛瘘的，肛瘘的彻底治疗方法主要就是通过手术进行治疗，目前在临床上也多是采用一次性的根治手术，去除原发的感染内口，切除肛瘘的管道部分以及外口。如果是一些高位的，复杂性的肛瘘一般会采用挂线的手术方法，最大程度上降低术后复发的几率，避免出现肛门组织的损伤。

肛瘘是属于感染化脓性的疾病，一般都是由于肛门周围脓肿发生溃破以后，所遗留下了管道，和肛周脓肿是属于同一个疾病的两个发展过程。如果通过药物治疗，只是以改善症状为主，起不到彻底治疗的作用。

肛瘘在手术以后保持生活习惯、饮食习惯、作息时间的规律，可以有效地降低术后复发的几率。