脑干梗塞和血栓的区别在于范围的不同、形成方式的不同、发病的时间不同。

第一，脑干梗塞应该包括了脑干的血栓，脑干血栓仅仅是脑干梗塞的一种方式。

第二，脑干血栓是因为栓子脱落以后，引起支配脑干的血管闭塞，脑干梗塞则是供应脑干的血管逐渐动脉硬化、斑块形成堵塞血管。但是也有可能是斑块脱落、房颤的栓子引起血管堵塞。

第三，脑干血栓发病较急，症状突然出现，而脑干梗塞则不一定。

无论是脑干梗塞或是血栓都需要溶栓、降脂、扩张血管以及改善微循环治疗。并且建议平衡膳食、养成良好的工作以及生活的习惯。