感染尼帕病毒会破坏中枢神经系统。

尼帕病毒一旦侵入体内，最主要的攻击对象是呼吸系统与中枢神经系统，可以导致人类或动物患上严重的呼吸系统疾病与脑炎。在发病初期，可出现与其他病毒感染类似的症状，比如全身关节疼痛、恶心、头痛等，随着病情的进展，可出现一系列的并发症。

若病毒侵入中枢神经系统可能会引起脑炎，这时可出现昏迷、意识模糊、恶心、头晕等表现。还有一些患者会出现严重的呼吸系统疾病以及非典型肺炎，甚至还会引起癫痫的发生。