皮脂腺囊肿和脂肪瘤主要区别如下：

脂肪瘤是脂肪细胞异常增生导致的，发病处常见于躯干、四肢以及腹腔的任何部位等。皮脂腺囊肿是皮脂腺外口堵塞时形成的现象，患处常见于毛囊比较丰富的区域，比如前胸、后背、头皮等。但是，两者都属于良性病变。

皮脂腺囊肿又称为粉瘤，粉瘤经常会合并感染的现象，发生感染时主要表现症状有局部红肿、疼痛，严重的甚至会出现破溃、流脓的症状，需要通过抗感染药物治疗，必要情况下需采取手术切除治疗，避免复发。而脂肪瘤没有明显症状，只有肿物大时出现压迫感，可以进行手术切除。