较小的会厌囊肿一般并无明显的不适症状，只有少数患者会感觉喉部不适，以及有异物感。通常本病在进行一些喉部检查时被发现，但有些较小的婴幼儿患有先天性会厌囊肿，常因生长较大，易导致喉梗阻以及出现呼吸困难等症状。

而对较小的会厌囊肿，若并无不适症状时可暂不做处理，但是要经常体检、密切观察。对较大的会厌囊肿囊肿，引起不适症状时需行手术切除。本病术后应做好后期护理，通常不易复发，但恢复期若有明显疼痛、出血等这类情况，要及时就医复诊。