肝囊肿做穿刺有癌变的迹象，应该立即予以手术治疗，切除有癌变迹象的肝囊肿。

肝囊肿在穿刺时进行了病理学检查，如果在病理学检查中发现有癌症迹象，则应该立即予以手术切除。对于肝囊肿有癌变迹象手术切除为肝部分切除术。因为一旦有癌症迹象，可能会导致肝囊肿癌变。

虽然肝囊肿癌变的几率非常小，但是一旦癌变，有可能会肿瘤生长、转移、扩散，这样就失去了手术治疗的时机。所以需要及早进行切除，肝囊肿癌变迹象切除后，预后一般良好。