一般情况下短肠综合征的病情不会影响到患者的性功能，因此大多数是可以进行同房的。

短肠综合征主要是因为小肠被广泛切除后，肠道的吸收面积变小，而造成患者出现营养不良症状的疾病，它的主要表现是顽固性的腹泻、水电解质紊乱和营养不良等，因此它在理论上对于性功能的影响比较小。

但是，如果患者的病情较重，比如残留的小肠长度很短，就会导致严重的机体营养不足，可能会出现相应的器官功能衰竭，对患者的心理和生理都会造成比较大的影响，这种情况下就会影响到同房。