造成胆肠吻合术后吃东西肚子胀的原因较多，由于消化道的改造，改变了原有的生理构造，所以人体需要一定的时间去适应，短期内可能出现腹胀。

术后吻合口的狭窄，导致胆汁不能有效的排入消化道，引起消化吸收障碍，尤其是在进食油腻食物时，腹胀更为显著，部分患者可出现脂肪泻。

胆肠吻合术前、术后均需要控制饮食，这就可能导致营养的不均衡，产生电解质紊乱，如低钾、低钠等，造成消化道的蠕动功能减弱，产生腹胀。

另外，任何形式的腹腔手术都有可能导致术后的肠粘连，造成梗阻，也可引起腹胀。